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질문 논문 읽다가 그래프의 용어를 잘 모르겠어서 질문합니다.
알믱믱(대학생)  | 05.10 01:48

학부생이라 너무 쉬운 질문일 것 같아요.. 근데 아무리 찾아봐도 저 용어들의 뜻을 모르겠어서요. 

1. IP가 면역침강이라는건 알겠는데 IP:SIRT7이라고 나와있으면 SIRT7을 면역침강으로 정제한걸 웨스턴블롯 시켰다는걸까요?

2. IB는 찾아봐도 도저히 안나오는데 무슨뜻인걸까요?

3. A와 B에 있는 Input은 양성대조군이 맞을까요? 그럼 무조건 밴드가 떠야되는거 맞죠?

4. C와D는 ChIP-qPCR한거라는데 세로축의 %Input은 무슨뜻인가요? A와 B에 쓰인 Input과는 다른 의미인가요?

5. C와 D에 있는 IgG는 무슨뜻인가요? 제가 아는 IgG는 항체밖에 없는데 갑자기 IgG가 나올리가 없을것 같아서요. 왜 굳이 비교를 한건지 또 항상 IgG가 더 적게 나오던데 그 이유도 궁금해요.

upload_image

#IgG
 
#Input
 
#IB
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리bio  |  05.10 08:40  

1. SIRT7으로 IP를 해서 SIRT7에 binding 하고 있는 partner 혹은 interacting protein을 보고자 함입니다.  여기서는 NRF1이 SIRT7의 binding protein이 될 가능성이 있다고 주장..
2. IB는 immunobloting 흔히 말하는 western blotting입니다. SIRT7-FLAG tag을 FLAG으로 IP한 다음 NRF1과 FLAG으로 western을 본 것입니다. 

3. input은 IP를 할 때 사용한 lysate를 말 합니다. lysate에 내가 원하는 단백질이 있어서 IP를 해서 pulling down했다고 주장하는 것입니다. 

4.아래 참조하세요. 

https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/epigenetics-noncoding-rna-research/chromatin-remodeling/chromatin-immunoprecipitation-chip/chip-analysis.html

5. IgG는 negative control입니다. IgG 항체에서는 잡히지 않았지만 SIRT7 antibody에서는 specific 하게 잡혔다는 것을 보여줍니다. 

 

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