실험 Q&A Mol. Biol.-RNA > Purification/Isolation
mRNA를 in vitro에서 합성하려고 합니다.
레벨1 펭숨 (대학원생)
안녕하세요 오늘도 교수님의 과제로 괴로운 대학원생입니다..
이번에 in vivo 혹은 in vitro에서라도 treatment할 mRNA를 만들어보라는 막연한 주제를 던져주셔서 실험실 세팅을 하려고 하는데,
cloning 과정이나 IVT 합성 과정이나 이런 것들은 키트에서 알려준대로 하면 되어서 큰 문제가 없는 듯 합니다.
문제는 mRNA로 만들어낼 부분의 sequence인데,, CDS 부분에 들어갈 것은 어느 정도 정리가 되었으나 앞뒤로 붙이는 UTR이라는 부분이 굉장히 중요하고 공개된 소스가 많지 않아서 어떻게 sequence를 짜야할지 이 접근에 대해서 오리무중인 상태입니다.. mRNA를 처리할 세포주에 따라서도 UTR이 중요하게 바뀌는 거 같아서 지금 해보라고 하신 세포주의 동물 타입이 3가지라 이것도 답답한 현실입니다.
이 실험에 대해서 깊은 이해가 있지 않아서 어떤 정보를 접근해야지 얻을 수 있는지도 모르겠어서 실상 인터넷 삽질만 계속하고 있는 중이네요..
해당 실험에 대해서 알려주실 수 있으신 분은 답변부탁드립니다.. 간절하네요..
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