실험Q&A를 통해 여러분의 지식을 나누어 주세요. 답변을 등록하시려면 로그인 해주세요.
본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
결국 단백질을 얼마나 깨끗하게 뽑았느냐가 관건입니다.
단백질이 깨끗하면 깨끗할수록 2-DE가 깨끗해지는거니까요.
metaprotein이라고해서 특별히 지저분한 2-DE가 나오는것은 아닙니다.
IEF와 gel preparation을 신경쓰시면 해결될 문제로 보입니다.
-
레벨6
Kozmoj
-
09.03.02 18:57
Soil 이나 기타 환경 시료로 부터 단백질을 분리해 metaproteome 을 한다면
일반적으로 실험실적으로 배양된 시료로 부터 분리하는 것 보다 깨끗한 결과를 얻기 어렵습니다.
당연하겠죠. 온갖 잡스러운 것들이 많이 들어있으니...
대략 논문을 검색해 보니
특별히 특정 시약을 처리하거나 하지 않고도 되나 보네요.
하지만, 많은 purify step 이 필요한 것 같습니다.
Soil 에서 metaprotein 을 뽑아 2-D 분석을 한 논문을 찾아 method 를 정리해 보세요.
그리고, 적용 가능한 방법을 set up 해서 시도해 보세요.
남들이 됐으면 令 님도 될껍니다.
The ISME Journal (2007) 1, 224–234; doi:10.1038/ismej.2007.39; published online 31 May 2007
Functional metaproteome analysis of protein extracts from contaminated soil and groundwater
에서 본 자료를 첨부합니다.
참고해 보세요.
Kozmoj님 감사 합니다..
근데 문제는 Kozmoj님께서 보여주신 논문으로 이미 해봤구요.. 그때 결과가 생각 보다 좋지 않아서 다른 방법을 찾고 있는 거거든요...
여튼 답변 감사합니다.