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lamp에서 프로브랑 퀀쳐까지 디자인해서 쓰는것은 너무 어렵고 효율이 제대로 나오기가 많이 힘들겁니다
관련 선행 논문들을 찾아보고 흔히 사용하는 검증된 primer-probe set대로 주문해서 본인 실험환경에 맞게 최적화 비슷하게 하는것이 일반적이라고 생각하구요,
굳이 만드신다면 probe 절반은 DNA에 붙고(BLP등과 동일하게)
나머지 절반은 퀀쳐와 상보적이게 만듭니다.
그래서 BLP+퀀쳐=프로브가 되게끔 만들어줍니다
사용하는 장비에 따라서 형광이나 퀀쳐는 바꾸시면되구요.
근데 이거 추가할 때 각각의 헤어핀 다이머 뿐만아니라 프라이머끼리의 상호작용도 봐야하고 Tm 등 각종 수치들 고려할게 너무나도 많습니다.
프로그램 툴들이 있긴하지만 항상 맞는건 아닌데다가 합성하는 비용도 형광이 달리면 꽤 부담스러워지죠
어떤 유전자를 증폭하시는진 모르겠지만 선행 연구가 있는지, 사용한 set을 찾아보심이 가장 빠르고 저렴한 방법이라고 생각합니다.
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레벨2
초코맛꿀
(일반인)
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21.12.07 21:45
소중한 답변 감사합니다. 도움이 많이 되었어요!
퀀쳐와 BLP 합친 프로브로 실험 해보려고요ㅎㅎ