실험 Q&A Microbiology > Fungi
특정 sample에서 metagenomics를 위한 PCR 결과해석이 궁금해서 질문드립니다!
레벨2 JJUUHH (대학생)
특정 샘플에서 곰팡이와 박테리아 메타지노믹스 분석 진행을 하기위해 DNA를 추출한 후 PCR을 진행하였는데 결과로 나온 band가 잘 진행된 결과인지 어떻게 확인할 수 있을까요?
특정 목표 세균과 곰팡이가 아니라 여러가지가 섞여있는데 어떤 크기에서 band가 떠야하는지를 어떻게 결정하나요?
PCR primer는 곰팡이는 ITS3-4를 타겟팅하였고
박테리아는 V3-4를 타겟팅하였습니다!
1째 lane은 100bp marker
마지막 lane은 1kb marker입니다
2번째, 6번째 lane이 ITS lane이고
8,9 번째 lane이 v3-4 lane이고 7번째 10번째는 각각 ITS, V3-4 negative control로 template DNA 대신 멸균한 3DW를 넣은 샘플입니다!
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