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같은종 같은 co1 타켓 시퀀스 align이 많이 다른 이유
레벨1 .학부생. (일반인)
안녕하세요.
ncbi를 통해 서열을 받고 mega7로 align을 하는데 같은 종이고 같은 co1인데도 서열이 많이 불일치한데 왜 그런지 모르겠습니다.
특이점으로는 A개체는 유니버셜 프라이머를 이용해 약 650BP정도의 서열이고 B개체는 다른 프라이머로 CO1에서 C02까지 연결해 약 1500BP가 나왔습니다. 이중약 890BP정도까지가 CO1이고요. 보통 두 개체의 시퀀스를 A개체의 650BP와 B개체의 CO1부부인 890BP까지를 불러와 ALIGN을 돌려보니 서열이 많이 불일치하는데 어디서부터 잘못된것인지, 그렇다면 해당 서열들로는 TREE를 그리는데 한계가 있는지 아시는분 답변 부탁드립니다..
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