[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
에이비클로널
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
Miami Winter Symposium 2023 – Molecular Neuroscience: Focus on Sensory Disorders 학회 참관기
전체보기 안전점검 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > etc.
조회 1347  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 snapgene에서 궁금한 질문이요
알살려주세요흑흑(대학원생)  | 2021.08.17 03:14

안녕하세요

시퀀싱 데이터 분석을 갖고 계속 검색하다가

원초적인 질문을 하게 되는 지경까지 왔네요..

 

pGBKT7 벡터를 이용하여 cloning을 완성시키고 시퀀싱 데이터 분석을 하다가 GAL4 binding domain 서열 중 하나의 염기서열이 어긋나reading frame따라 코돈 읽어보고 이상이 없는지 확인하려 검색하던 찰나에

 

snapgene 파일에서의 아무런 표식이 없는 검은 선으로 이루어진 부분이 궁금해져 여쭤보게 되었습니다.

다른 벡터를 이용하여 gDNA를 이용한 insert 삽입시 인트론 부분은 소문자로 나오는데.. 저 부분은 UTR도 아니고 프로모터도 아니면 인트론인가요? 인트론이 아니라면 무엇인가요? 아니면 ori라고 되어있는 부분인가요?ㅠㅠ

 

(또한 pGBKT7 이나 pGADT7 을 사용하신 분들이나 비슷한 백터, 혹은 cloning 많이 하신분들께 여쭤보면..binding domain은 벡터 시작부분부터 3개씩 염기서열 자르는게 아니라 그냥 binding domain 해당 서열부터 잘라서 읽으면 되나요?ㅠㅠㅠ)

#vectormap
 
#intron
 
#snapgene
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리1st_Philekorea  |  2021.08.17   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

안녕하세요? 필코리아테크놀로지입니다.

 

질문해주실 때 그림을 붙여놓으시면 답변하기가 수월하고 정확하게 답변가능합니다.

 

답변이 어려울 것 같습니다...

지금 상황이.... alignment한 것이라면,

그냥 선으로 되어 있는 것은 align되지 않은 서열들(match up되지 않은..)입니다.

 

 

스냅진 뷰어는 기능이 완전한 공짜프로그램이 아니어서 사용이 어려운 점이 있어서.. 구글링으로 APE plasmid editor를 검색해보시면.. 공짜로 에디팅부터 alignment까지 전부 가능한 프로그램입니다. 참고부탁드립니다.

 

 


감사합니다.

(주)필코리아테크놀로지

답변하기
할인행사/신제품신기술 광고 검색광고
이츠바이오 이츠바이오
[abm] PCR Products 1+1 및 20% 할인 행사!! (4.28까지)
서린바이오사이언스 서린바이오사이언스
[Cell Signaling Technology] Conjugated Antibody 20% 할인 이벤트!! (4.30까지)
바이오닉스 바이오닉스
[TECAN No.1 한국공식대리점] TECAN 봄맞이 대행사! 견적 및 Demo 신청시 상품권 지급 (4.9까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
Mic qPCR 체외진단의료 기기 GMP 취득 EVENT ! (~23년 6월 30일 까지) (12.31까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
Spatial Transctiptome 분석 Tumor Microenvironment(TME) 연구의 새로운..
인성크로마텍 인성크로마텍
[BQC] 산화 스트레스(Oxidative Stress) 분석 / 세포 분석 / 조직 염색 키트 20% 할인 (4.28까지)
최근등록   더보기 >
Trypton,pepton   03.24
메탄올 용매 용해 독성   03.24
cloning 실험하는데 dna 몇 최소 ng 있어야 사용가능한가요?   03.24
blue-white screening 실험에서 전기영동을 하는 이유가 뭔가요?   03.24
40% 아크릴아마이드를 30%아크릴아마이드로 농도를 낮추고 싶습니다.   03.24
PCR전기영동 분석   03.24
논문 투고시 저자 이름, 이메일 대해 질문 드립니다.   03.24
MTT 실험 시 사균처리   03.24
부레옥잠에서 사포닌 추출   03.24
PCR기계   03.24
최근답변자 우수답변자
대왕개구리SPEED

개구리실험조아

알enen

알나는야학부생

알Choip

알친절하게살자

개구리새슬

개구리clickclick

개구리겨우살이

개구리현직백수

꽃개구리Ip Man

개구리Kim

개구리cslee

개구리겨우살이

대왕개구리SPEED

꽃개구리visavis

실험관련연재
세오 연재중실전 실험 프로토콜 101
세오 (필명) (Cincinnati Children’s Hospital Medical Center)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
박은총 연재마감후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
Mr.S 연재마감의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재마감실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
이제욱 연재마감생명과학자 기초체력 다지기
이제욱 (오송첨단의료산업진흥재단, 신약개발지원센터)
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
엘앤씨바이오 광고