실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > Sequencing
시퀀싱에 대해서 궁금증이 생겨서 다시한번 글을써봅니다
레벨1 노예 (대학생)
저번에도 질문을 올렸던 실험실에 대학원생이 없는 학부생입니다!
실험진행중에 한가지 의문이 생겨서... 답변기다리겠습니다 !!!
3천bp 크기의 시료를 시퀀싱해서 파일을 받았는데
절반정도인 1600bp만 결과가 나온거에요
맡긴회사에 전화해보니 3천이넘으면 다 나오긴 힘들고 1500정도만 나올수 있다고 하더라구요
그래서 이부분을 프라이머를 다시 짜서 붙일려고 생각중인데
포워드 부분에 해당하는 프라이머쪽 염기서열 800쯤과
리버스 부분에 해당하는 프라이머쪽 염기서열 800쯤이 있어요 지금
그런데, 여기서
예를들어 포워드의 atgcatgc
리버스의 atgcatgc
이라면
1. 두개를 이어붙인다고 할때 atgcatgcatgcatgc 라고 임의로 이어붙이고 프라이머를 다시 만들어서 진행하면 중간쪽 안나온 부분이 나올까요?
1-1. 이걸 생각한 이유가 PCR을 하면 진행 방향이 반시계방향이잖아요(미토콘드리아 DNA에서) 반시계방향으로 진행되니까 오차가 생기지않을까해서요...
primer walking도 찾아봤는데 저희 교수님의 취지는 그게 아니어서 직접 이어붙이는것을 목표로 해보라고하셔서요
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