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질문 ANOVA, GLM, t-test, Duncan의 차이점이 뭔가요??
청개구리CLOVA(대학원생)  | 2021.05.12 17:16

qRT-PCR 결과를 가지고, 통계분석을 하려고 하는데..
SAS 프로그램 익히는 게 너무 어렵네요..

일단, 저 4개의 통계분석의 차이에 대해 정확하게 알아야
내가 무슨 통계분석을 사용해야하는지 감이 잡힐 거 같아 질문올립니다.

 

ANOVA

ANOVA에 대해서는 대충 학부 수업시간에 배운 내용으로는
one-way(일원배치)와 two-way(이원배치)로 나뉘며,

one-way는 변수가 1개 (보통 세포실험이라면 처리군의 농도),
귀무가설(H0) 설정은 농도별로 효과가 없다
대립가설(H1) 설정은 농도별로 효과가 있다

two-way는 변수가 2개 (처리군의 농도와 시간별 차이를 둘 다 확인)
귀무가설, 대립가설 모두 3쌍이 필요 (농도별, 시간별, 농도와 시간 함께 비교)

이 정도 수준으로만 알고 있고,

현재, 엑셀을 사용하여 MTT assay 결과(Control 1개와 3개 농도의 처리군)를
one-way ANOVA를 통해 p-value 값을 확인하였습니다.

 

t-test

t-test는 독립표본 t-test와 쌍체표본 t-test로 나뉘며,

독립표본 t-test는 '남녀 키에 대한 평균의 차이'를 알고 싶을 때,
즉, 독소미처리군과 독소처리군 간의 유전자 발현의 변화를 보고싶을때??

쌍체표본 t-test는 '마우스의 현재 평균 체중과 한 달 후의 평균 체중의 차이'를 알고 싶을 때

사용한다라고만 알고 있습니다.

 

1. 제가 알고 있는 대로라면, 
qRT-PCR을 Control과 독소처리군이 1개든 2개든을 가지고 비교할 때,
qRT-PCR 통계분석시
one-way ANOVA와 독립표본 t-test를 사용하면 되는 건가요??

 

 

그리고, GLMDuncan에 대해서는 자세하게 설명되어있는 블로그나
BRIC 글들이 보이지 않던데..
 

2. GLM과 Duncan은 무슨 원리인지 알려주실 분 계시나요??
알고있는 거라곤 'GLM 안에 ANOVA가 들어있다'인데..
그럼, ANOVA 대신 GLM만 돌려도 되는건가요??

 

3. ANOVA와 t-test만 돌려도
qRT-PCR 결과에 신뢰성이 있는지 확인하는 데는 충분한가요??

통계유전학 너무 어렵네요..
 

#qRT-PCR SAS 어려워
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리무광  |  2021.05.13   

여기에서 통계학 원리를 설명하는건 어렵고, 원리가 궁금하시면
스스로 기초통계학 서적부터 넷 자료를 찾아서 공부하는 수 밖에 없습니다.

일반적인 wet 생물학자 연구에서 간단히 설명 드리겠습니다.

결국 t-test와 ANOVA의 활용의 차이라고하면

t-test는 2군 간의 비교를 할 때 쓰고 (A,B)
ANOVA는 3군 이상의 비교에서 씁니다. (A, B, C ~)

ANOVA 후 각 그룹간 p-value를 구할 때 사후검정 (post-hoc test)를 합니다. 사후검정엔 Tukey, Dunnet, Duncan 여러가지 test들이 있습니다. 각 사후검정들의 목적도 다르고 각 검정에는 사용할 수 있는 조건이나 장단점이 있습니다.

또한 t-test나 ANOVA도 무작정 쓸 수 있는건 아니고, 사용하기전에 자신의 샘플 데이터들이 pair 혹은 unpair 데이터인지, 정규성(정규분포를 따르는가?)이 있는지, 그룹간 분산은 차이가 있는지(공분산검정) 따져봐야합니다. 

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