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 전체 > Chemical biology > Extraction/Concentration
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질문 Lysis buffer의 양
Lysis buffer  | 2009.01.13 11:30
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
cell을 lysis 시킬 때 최대한 농축시켜 얻고 싶은데,
10cm dish에 lysis buffer를 150uL 정도 넣고 scraper로 열심히 긁어냈는도,
protein 얻은 후 정량 결과는 보통 때와 별 차이가 없습니다. (1mg/ml 정도)
lysis buffer를 너무 조금 넣으면, cell lysis 자체에 제한이 생기는지요.
(게다가 lysis buffer를 150uL밖에 안넣었는데, 30분 incubation후 sample을 수거해보면 250uL 이상이 나옵니다. 이건 왜 그럴까요?)

아는 선배님이 lysis buffer의 양은 별로 중요하지 않다면서, cell을 scaraper로 긁은 후 centrufuge해서 pellet만 남긴 후 lysis buffer를 넣어 보라고 해서 그렇게 해봤는데(lysis buffer 약 100ul per 10cm dish), 결과는 오히려 약간 더 나쁩니다.

이야기가 장황해졌는데, 어쨌든 cell lysis 후 최대한 농축된 protein을 얻고 싶으면 어떻게 해야 할까요.
도움 부탁드립니다.

미리 감사드립니다. 꾸벅
#lysis buffer
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
알라키  |  2009.01.13   
제 경험으로는 lysis buffer 양이 많다고 해서 무조건 protein이 많이 얻어지는 것이 아니더라구요. 그래서 저는 lysis buffer 양을 조절해가면서 protein 이 가장 많이 얻어지는 조건을 찾아서 실험했어요.
(근데 괄호에서 하신 질문은 저도 잘 이해가^^;;)

그리고 저도 c/f 후에 pellet에 다시 lysis buffer을 넣어 suspension 한 후에
다시 c/f 하는 방법도 해봤는데
(보통 2,3번정도까지 이런식으로 계속 반복하는 경우도 있더라구요)
저도 별 차이 없었어요.

저는 buffer양 조절해가면서 조건을 찾아보시는게 좋을 것 같은데
좀 귀찮고 시간이 아까운 작업이긴 하죠^^;;
대왕개구리안재진  |  2009.01.13   
저는 100mm DISH에 150ul를 넣어줍니다. 그러면 나중에 대략 200ul정도가 되던데... 그래서 5X sample buffer를 50ul넣어주어 사용합니다.
위에님처럼 조건을 잡아봐야 겠다는 생각을 해본적이 없어서... ㅠㅠ

암튼... 최종적으로 lysis를 시키고 나면 볼륨은 늘어 납니다. 세포내 세포질이 터져 그러한듯 합니다.
whatever  |  2009.01.14    
제 말이 꼭 맞다고 할 수는 없지만, 적은양의 라이시스 버퍼로 뽑을 수 있는 프로틴의 양은 한계가 있는것 같습니다. 제 경험상 100 mm 디시 정도에는 적어도 1 ml 정도의 라이시스 버퍼를 넣었습니다. 셀마다 다르겠지만, 주로 많이 쓰는 HEK293 의 경우 100 mm 디시에 꽉차게 키웠다면 1 ml의 라이시스 버퍼로 적어도 4~5 mg 은 나옵니다. T25 Flask 의 경우는 2~3 mg 정도구요.
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