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PCR 증폭 효소는 DNA만 증폭 가능합니다.
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레벨5
Marine
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21.02.23 13:48
RNA 로 PCR 을 하려면 RNA를 Template 로 해서 RNA를 생성 할 수있어야 하는데(증폭을 계속 해서 양을 늘려야 하므로), 이에 활용할 수 있는 Enzyme은 없습니다.
그러므로 RNA 를 cDNA 로 만들고 이를 Template 로 해서 DNA 를 합성하는 DNA polymerase 를 활용하는 것 입니다.
정확한 답변을 드리면,
RNA dependent RNA Polymerase (RdRP)는 있습니다.
최근에 아주 친숙한.. Covid-19가 이 효소를 사용해서 스스로를 증폭하죠.
그런데, PCR이라는 과정은 Denaturation- Annealing - Extension - Denaturation이 반복되는 실험입니다. Denaturation를 위해서는 95도의 높은 온도로 가열을 해야하는데, RdRP는 이런 고열에 버티지를 못합니다. Polymerase가 변성되어 효소의 활성이 떨어집니다. 그래서 RNA를 바로 사용하는건 불가능하죠.
1-step qPCR을 이용한다면, RNA 샘플에서 tube변경 없이 qPCR로 바로 진행 가능합니다.
(실험 과정 중에 RNA에서 cDNA를 합성하는 과정이 포함되어있습니다.)