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레벨1
jmpark1
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21.01.08 17:40
간단히 답변 드립니다.
질문1. MS와 MS/MS은 어떤 차이점이 있는건가요??
MS는 일반적으로 알고 있는 MALDI-TOF, LC-, GC-MS 분석법으로서, MALDI-TOF MS의 경우 시료에 레이저를 조사, 이온화된 시료가 detector에 도달하는 시간을 측정하여 이를 mass/charge ratio (m/z)로 환산하여 나타냅니다. MS/MS는 MS2로도 표기하는데, MALDI process를 통해 발생되어 TOF 관을 통해 이동하는 시료 이온 중 연구자가 원하는 특정 시간대의 이온만을 선택적으로 통과시켜 CID(collision induced dissociation) 등의 방식으로 fragmentation 시킵니다. Fragmented ion을 2번째 TOF 관으로 통과시켜 detector에 도달하는 시간을 측정하여 스펙트럼으로 나타내어 연구자가 원하는 분자량을 갖는다고 추정되는 시료의 fragmentation pattern을 볼 수 있고, 이를 통해 protein identification 등과 같은 분석을 할 수 있습니다. MS/MS 분석을 하기 위해서는 일반 MALDI-TOF 장비가 아닌 MALDI-TOF/TOF 와 같은 장비가 필요합니다.
질문2. 아래의 그래프는 논문의 PEG(polyethylene glycol) MALDI-TOF 그래프인데, m/z +44 신호는 어떻게 확인할 수 있나요??
그래프에 나타난 두 개의 피크간 molecular weight 차이가 44 라는 의미입니다. PEG 의 monomer size가 44.05 Da 이므로 그래프에 나타난 각각의 피크는 서로 다른 개수의 PEG monomer를 포함하는 분자를 의미합니다.
질문3. 이 전에 평균분자량을 확인하기 위해 maldi-tof 분석을 했을 때에는 그래프와 Mw 데이터 정도만 받았는데, 아래의 m/z+44 신호는 따로 확인할 수 있는 프로그램이 있는건가요?
MALDI-TOF 분석을 수행함으로써 얻을 수 있는 기본적인 raw data는 위 그래프를 그릴 수 있는 m/z 값과 대응되는 intensity 값 입니다. MALDI-TOF 기기 전용 분석 프로그램도 당연히 있습니다만 raw data만 가지고도 그래프를 plot 해보면 피크 간 mass 차이를 확인할 수 있습니다.
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레벨1
lyn1344
(과기인)
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21.01.11 15:27
긴 글로 자세한 답변 적어주셔서 감사합니다.
추가로 질문사항 있어 댓글 남깁니다.
질문1. 두 개의 피크간 molecular weight 차이가 44라는 사실만 알고 있을 경우, 이 물질이 PEG라는 사실을 어떻게 알 수 있나요? 이미 알고있는 물질 외에 28, 88등이 나왔을 경우 이 물질이 무엇인지 어떻게 알 수 있나요? 정리되어 있는 library가 따로 있는 건가요?
질문2. 이전에 MALDI-TOF 분석을 의뢰하여 polytool 소프트웨어로 분석한 결과를 받은 것이 있는데 혹시 molecular weight 차이라는 것이 rep.unit을 의미하는 것인가요? 그렇다면 resid. 는 무슨 의미인가요?