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레벨5
SCIENTIST00
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20.12.22 05:42
우선 단백질 결정의 구성을 알아야 합니다. 단백질 결정은 보통 40-60 % 정도가 해당 단백질로(원자) 구성되어 있고 나머지 40-60%는 물 (solvent)로 구성되어있습니다. solvent content가 낮다는 말은 결정안에 단백질 구성 원자가 차치하는 부피가 많다는 것이고 X선을 결정에 노출시켰을때 조밀한 원자구성으로 X선 회절을 잘 시키게 됩니다. Matthew coefficient는 단백질 결정의 부피를 구성하는 단백질의 분자량으로 나눠서 계산되어 집니다. 단백질 결정의 unit cell의 paramete를 알게되면 계산할 수 있습니다. 구글에서 matthew coefficient 계산을 검색하면 계산할 수 있는 웹툴이 있습니다.
어떤 단백질 결정의 unit cell을 알지못한다면 계산할 수 없는 값입니다. X선 실험을 통해서 solvent content가 높은지, 낮은지는 추청해 볼 수 있기는 하지만 회절데이터를 통해서 unit cell을 분석해야만 정확한 값을 알 수 있습니다.