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질문 Blue Native Gel 내려보신 연구원님들의 조언을 구합니다.
알neto543(대학생)  | 2020.12.10 15:17



안녕하세요, 추운날씨 다들 건강들 하신지요.

 

다름이 아니라 이번에 BN Gel을 내려야 할 일이 생겨서 몇가지 여쭈어 봅니다.

 

우선 보고자 하는 단백질을 Membrane Protein은 아니고 Soluabe phosphatase 입니다. 단백질 정제 한 후 Complex로 존재하는지 알아보려 하는 실험입니다.

 

1. Native Gel 의 경우에 Bromophenol Blue를 이용하여 Bis-Tris Gel로 수행하는 Protocol은 많이 나와있어 정리해 놓았는데 BN Gel의 경우에는 유독 Anode와 Cathode Buffer를 나누어 만드는 흔히 Tricine sds page 에 사용하는 방법으로 많이 나와있어서요, 혹시 특별한 이유가 있는지 여쭈어 봅니다.

 

2. 앞서 말씀드렸듯이 저의 경우에는 Membrane protein이나 Insoluable한 Protein을 Gel상에서 확인하는 것이 아닌 이미 Soluable 한 단백질들만을 정제해서 이용하는데 Aminocaproic acid 같은 것들을 넣어줄 필요가 있을까요 ?

 

3. 전기 영동 후에 Band를 다시 얻어 주려고 계획중인데요, Dialysis Bag 에 Band 를 잘게 잘라서 전기장을 걸어주려고 하는데 문제가 될까요 ?

 

4. 마지막으로 아래와 같이 Buffer 만들어 준비하려고 하는데 조언 부탁드립니다.

Buffer composition

 

Electrophoresis Buffer (1L)

3.0g Tris

14.4g Glycine

 

5x Sample Buffer (10ml)

312.5 mM Tris-HCL(pH6.8)

50% Glycerol

1% Comassie blue

 



#전기영동
 
#Purification
 
#Gel
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2020.12.10   

- 비변성 SDS-PAGE로 분석하면 됩니다.

- Native는 몇번 전기영동 하면서 조건을 조정해 봐야 합니다.

한번에 최적 조건이 나오지 않고 band resolution이 안좋습니다.

- 전기영동 후 단백질을 회수 해서 사용하려면 염색하지 않고 gel을 잘라내고 

electroeleution하면 됩니다.

- 염색하면 MS/MS 분석은 가능합니다.

- sample buffer에 Comassie blue가 들어가나요?

 

알neto543  |  2020.12.10   

빠른 답변 감사드립니다.. 

Comassie Blue로 Sampling 하여 주는게 BN Gel과 일반 Native Gel의 특성으로 알고 있어서 넣었습니다.

 

혹시  염색을 안할경우에 Band를 어떻게 확인하여서 그 부분만 잘라서 취 할 수 있을까요 ?  

대왕개구리SPEED  |  2020.12.10   

1 lane 만 잘라서 염색합니다.

- 비변성 SDS-PAGE를 한 후 1 lane은 잘라서 염색, 남은 gel은 SDS 제거.

- 염색 후 탈색하여 SDS가 제거된 gel과 수평을 맞춰서 원하는 단백질을 

잘라내어 electroelution.

- 변성 및 비변성 SDS-PAGE로 단백질 확인하면 됩니다.

 

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