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 전체 > Molecular Biology-DNA > Gene Cloning
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질문 Gene copy number 개념 관련해서 문의 드립니다.
알뿌치빠치뽀치(일반인)  | 2020.12.01 17:27

 

안녕하세요.

gene copy number에 대한 개념이 확립되지 않아서 문의 드립니다 ㅠㅠ..

하루종일 gene copy number에 대한 개념들 찾아보고 논문들 봤지만,

자꾸 도돌이 표로 이해가 가지 않는데,

transgene 의 발현에 대한 연구인데,

여기서 transgene의 gene copy number를 확인하는데 그 이유와 gene copy number가 dna replication 과 같은 개념인지 궁금합니다.

 

gene copy number 분석 시, genomicDNA를 추출해서 분석하는데 세포당1개의 gDNA를 가지고 있는 것으로 아는데,

이 genomicDNA의 copy number 를 구하는 이유에 대한 개념이 자꾸 안서네요..

나름 찾아보고 공부하려 했는데, 확실한 개념 잡고자 질문 드립니다 ㅠㅠ

 

 

#gene copy number
 
#genomicDNA
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리강시  |  2020.12.01   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

대장균의 예를 봅시다.

대장균에 염색체에 A 유전자가 하나 존재한다면 1 copy 라고 말합니다.

A 유전자가 두 개 존재한다면 copy number는 2 입니다.

transgene을 만들때, 넣어준 유전자 construct가 딱 하나만 염색체에 삽입되는 경우도 있지만 두 세 개가 들어가기도 합니다. 이 때, 두 세개가 들어건 경우, 유전자의 gene copy는 2 또는 3이 되는 겁니다.

 

한 세포에 유전자가 하나 들어가 경우와 세개 들어간 경우를 봅시다. 

만일 그 유전자 산물이 어떤 효소라면 그 세포가 발현하는 효소의 activity는 유전자의 copy number와 비례할 수 있을 것입니다. 그래서 trangene의 copy number를 확인하는 과정이 필요한 것입니다.

개구리bio  |  2020.12.01   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

DNA replication보다는 Transcription과 더 관련이 있겠죠..

보통  특정 promoter와 함께 integration시키니깐..

genomicDNA의 copy number 를 구하는 이유는....

렌티 바이러스 이용시에는 random intetgration이기 때문에 너무 많은 copy number가 만들어지면 artifact에 의한 현상으로 생각될 수 있습니다. 그래서 MOI 계산해서 transduction을 시행합니다. 그리고 만들어진 cell들의 genomic DNA 를 뽑아서 copy number 를 구해서 몇 copy 가 integration 되었는지 확인합니다 (vector copy number/VCN). 

gene editing의 경우는 특정 locus에 specific integration이 되는데 사람 세포의 경우 two allele가 있으니깐 한개 아님 두개 이겠죠.. 이것을 확인하기 위해서도 요즘 copy number를 많이 확인합니다.   

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