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레벨5
BlackSmile
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20.11.09 21:34
Cell signaling에서 판매하는 p-Jak1 antibody의 정보를 보면
Human Jak1 residues Tyr1034 and Tyr1035 historically have been referenced as Tyr1022 and Tyr1023
라고 적혀있네요.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4739517/
보내드린 reference의 method에도 비슷한 내용이 언급되어 있는걸 봐서는, 같은 antibody인거같은 느낌이 듭니다.
만약 윗분의 답변처럼 같다면 혹시 누구는 시그널 펩타이드를 마이너스하던지 플러스하던지 해서 계산한 걸 수도 있습니다.
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레벨2
호안미로
(대학생)
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20.11.10 10:37
답변주셔서 감사합니다. 인산화부위에 따라 항체가격에서 약간이나마 차이가 있어서 같은 항체일거라 생각하지 못했습니다 .. 이 가격차이는 왜 생긴걸까요..흠..
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레벨1
(주)큐벳qvet
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20.11.17 14:10
<pre>
위에서 잘 말씀해주셨지만 조금만 부연설명을 하자면
사람의 Jak1 단백질 서열은 다음과 같습니다.
sp|P23458|JAK1_HUMAN Tyrosine-protein kinase JAK1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=JAK1 PE=1 SV=2
<span style="background-color:#e74c3c">M</span>QYLNIKEDCNA<strong><span style="background-color:#e74c3c">M</span></strong>AFCAKMRSSKKTEVNLEAPEPGVEVIFYLSDREPLRLGSGEYTAEEL
CIRAAQACRISPLCHNLFALYDENTKLWYAPNRTITVDDKMSLRLHYRMRFYFTNWHGTN
DNEQSVWRHSPKKQKNGYEKKKIPDATPLLDASSLEYLFAQGQYDLVKCLAPIRDPKTEQ
DGHDIENECLGMAVLAISHYAMMKKMQLPELPKDISYKRYIPETLNKSIRQRNLLTRMRI
NNVFKDFLKEFNNKTICDSSVSTHDLKVKYLATLETLTKHYGAEIFETSMLLISSENEMN
WFHSNDGGNVLYYEVMVTGNLGIQWRHKPNVVSVEKEKNKLKRKKLENKHKKDEEKNKIR
EEWNNFSYFPEITHIVIKESVVSINKQDNKKMELKLSSHEEALSFVSLVDGYFRLTADAH
HYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGMYVLRWSCTDFDNILMTVT
CFEKSEQVQGAQKQFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGDLMSHLKKQILRTDNISFML
KRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDLVQGEHLGRGTRTHIYSG
TLMDYKDDEGTSEEKKIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRD
VENIMVEEFVEGGPLDLFMHRKSDVLTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNL
LLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLSRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFG
TTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTRCMNYDPNQRPFFRA
IMRDINKLEEQNPDIVSEKKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDN
TGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLP
SGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIG
DFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDS
DSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRT
SFQNLIEGFEALLK</pre>
제일 처음 시작 코돈부터 두번째 시작코돈까지의 아미노산 개수가 12개입니다.
translation variant를 제일 처음 보고하신 분이 두번째 시작 코돈을 기준으로 작성을 하셔서 혼선이 있었던 부분으로 여겨집니다.
항체가 부착되는 epitope 부분은 동일한 구역이지만 두번째 시작코돈을 기준으로하면 tyr1022/1023
첫번째 시작코돈을 기준으로하면 tyr1034/1035이 되는 것입니다.
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레벨2
호안미로
(대학생)
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20.11.20 11:45
명확하게 알 수가 없어 답답했던 부분이었는데 정말 감사합니다!