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질문 Taqman probe에 대해 질문 드립니다.
알꼬승(과기인)  | 10.29 14:17

제가 Taqman probe를 제작하려고 하는데 기존에는 SNP를 구분하는 probe가 아닌 일반적인 taqman probe를 제작하였습니다.

 

이번에는 SNP를 가지고 구분되게 제작을 하여야 하는데 중간부분에 SNP가 존재하면 되는지, 아님 3말단이나 5말단 부분에 SNP를 존재하게 하여야 하는지 궁금하여 질문을 남깁니다.

#Taqman
 
#probe
 
#SNP
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리Marine  |  10.31 18:43  

양 말단 프라이머가 아닌 중간의 Taqman probe 에 SNP site 가 존재하게 디자인 해야 하는 것으로 알고 있습니다.

아래 참고하시길!

https://www.applied-maths.com/applications/taqman-based-snp-genotyping

알꼬승  |  11.05 18:10  

제가 만들고자 하는 부위는 forward primer로부터 약 30bp 떨어진 SNP입니다. 이 SNP 위치가 probe의 5말단에 위치해야되는 것인지, 아니면 3말단에 위치하여야 되는 것인지, 중간에 위치해야되는 것인지 궁금합니다.

 

제가 질문 설명을 제대로 못한것 같습니다.

 

죄송합니다.

개구리Marine  |  11.09 15:26  

SNP site 는 일반적으로 Taqman probe 의 중간부분에 위치하도록 하는 거 같습니다.

참고로 Taqman probe 는 대부분 Thermo-fisher 등의 전문 업체들에 제작을 의뢰하게 되는데, 가지고 계신 sequence 를 보내주면 업체에서 가지고 있는 프로그램 돌려서 최적의 Set 들을 제안 해 줄거라, 그 담당 사원에게 물어보면 더 잘 알려줄 수도 있습니다.

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