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레벨5
Marine
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20.10.31 18:43
양 말단 프라이머가 아닌 중간의 Taqman probe 에 SNP site 가 존재하게 디자인 해야 하는 것으로 알고 있습니다.
아래 참고하시길!
https://www.applied-maths.com/applications/taqman-based-snp-genotyping
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레벨1
꼬승
(과기인)
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20.11.05 18:10
제가 만들고자 하는 부위는 forward primer로부터 약 30bp 떨어진 SNP입니다. 이 SNP 위치가 probe의 5말단에 위치해야되는 것인지, 아니면 3말단에 위치하여야 되는 것인지, 중간에 위치해야되는 것인지 궁금합니다.
제가 질문 설명을 제대로 못한것 같습니다.
죄송합니다.
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레벨5
Marine
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20.11.09 15:26
SNP site 는 일반적으로 Taqman probe 의 중간부분에 위치하도록 하는 거 같습니다.
참고로 Taqman probe 는 대부분 Thermo-fisher 등의 전문 업체들에 제작을 의뢰하게 되는데, 가지고 계신 sequence 를 보내주면 업체에서 가지고 있는 프로그램 돌려서 최적의 Set 들을 제안 해 줄거라, 그 담당 사원에게 물어보면 더 잘 알려줄 수도 있습니다.