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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 아가로스 젤이 쪼개졌어요...
알Sierra(대학생)  | 10.28 22:50

전공 실험을 하면서 DNA ladder를 확인하기 위해 electrophoresis를 위한 1% agarose gel을 만들었습니다. 그때 같은 실험실에서 같은 버퍼와 재료들을 나눠 쓴 다른 조들은 그렇지 않았는데 저희 조의 젤만 DNA sample을 주입하던 중 well부분의 gel이 쪼개졌어요

크게 다른 조들과 차이가 났을 요인을 생각하면 전자레인지를 1분 15초를 돌리고 앞에서 보고 있지를 않아서 너무 많이 버퍼가 기체로 나가버렸을 가능성이 있고요,

각자 buffer와 powder을 알아서 양을 재서 만들다 보니 농도가 조금씩 차이가 났을수도 있고요

gel을 tray에 부을 때 gel이 전자레인지에서 나온지 조금 오래돼서 마지막에는 살짝 굳으면서 tray에 들어가서 gel모양이 조금 울퉁불퉁했습니다.

그래도 gel을 다 굳혀서 tank로 옮길때 까지는 깨지는 기미가 보이지 않았는데 3번째 well에 sample을 주입한 후 갑자기 sample들이 tank에서 날아다녀서 봤더니 well부분이 위로 절반으로 쪼개졌더라고요,,, 

쪼개진 이유가 뭔지 아시겠나요..?crying

#젤 깨짐
 
#electrophoresis
 
#젤쪼개짐
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리동물연구  |  10.29 12:09  
젤을 찢어먹어서 그래요. 부주의한 실험 이었네요.
겔 로딩 할때 감으로 깔끔하게 로딩하기 위해서 피펫에
들어간 샘플을 조심히 분주하세요. 겔 버퍼는 완전히 녹히고 용량이 맞게 들어갔으면 바로 굳지 않아요.서서히굳어요. 실수투성이 실험이네요..
민희준  |  10.29 15:03   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

겔을 찢으셨네요,, 전기영동 10번만 각잡고 더해보면 겔 찢을일 없을 겁니다

약간의 팁을 드리자면, loading은 10ul 팁을 쓰는 것 보다 20ul 피펫에 200ul 사이즈의 팁을 사용해 로딩하는 것이 더 좋습니다. 

10ul 팁은 아주 뾰족하고 짧아서 초보자들이 겔에 꽃아 찢기 쉽습니다. 

더군다나 겔에 로딩할때 눈으로 보이는거랑 팁이 들어가는 방향이 다르죠 액체의 전반사와 굴절 때문에,,

그래서 200팁을 사용하여 좀더 길고 상대적으로 뭉툭한 팁을 사용하여 더 쉽게 로딩할 수 있습니다.

처음하실 때는 팁을 Lane의 벽면에 약간 댄다는 느낌으로 위치를 찾고, 아주 천천히 로딩하세요 200팁은 갖다 댄다고 겔이 찢어지지 않습니다

화이팅입니다

알Sierra  |  10.29 22:59  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

답변들 감사합니다~! (어떻게 답글을 달아야할지 몰라서,,,)

DNA extraction하는 중간중간에 gel을 만들어서 시간이 지체되었었나 봐요,,,

여러 팀원이 같이하는 실험이라 sample주입도 돌아가면서 했는데 3번째는 제가 하지 않아서 언제 어떻게 gel이 찢어졌는지는 아직도 정확히 모르겠지만 앞으로 진행할 실험에 있어 중요한 도움이 되었습니다. 

감사합니다!!

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