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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
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질문 박테리아 실험(미생물 동정, PCR, qPCR)에 대해 질문드립니다!
알신군(대학생)  | 09.20 16:55

박테리아 실험 관련해서 궁금한 것이 있어 이렇게 질문합니다... 이쪽 관련해서 아무런 지식이 없어 엄청 기초적인 것일 수도 있지만 부탁드립니다ㅠㅠ

1) 제가 16S rRNA의 염기서열 분석을 통해 토양 속에 있는 박테리아의 종류를 알아내려고 합니다만 16r rRNA염기서열 분석의 경우 균주?(strain)의 종류가 아닌 그 안에 속해 있는 박테리아의 종류를 알아내는 건가요?

2) 16S rRNA의 추출은 어떻게 하는 건가요? 이게 말이 RNA지 DNA를 추출해서 분석한다는 이야기를 본 적이 있는데 확실히 잘 모르겠습니다...ㅠㅠ 그리고 RNA든 DNA든 어떻게 추출하는 걸까요..ㅠㅠ

3) 제가 nifH 유전자를 qPCR을 통해 정량적 분석을 하고 싶습니다만 이 경우 토양에서 kit를 통해 추출한DNA를 그냥 사용하면 되는건가요? 아니면 그 DNA를 다시 질소가 없는 배지에서 배양한 뒤 콜로니를 생성한 박테리아만을 분석해야되는 건가요?

4) 만일 콜로니에서 생성된 박테리아를 분석할 경우 어떻게 추출할 수 있을까요...?ㅠㅠ

5) 아 그리고 앞서 말했듯 16S rRNA는 PCR을 통해 nifH 유전자는 qPCR을 통해서 분석할 예정입니다만 16S rRNA도 PCR기계가 아닌 PCR 분석장치로도 염기 서열을 분석할 수 있나요?

박테리아 관련된 연구실이 아니여서 어디 물어볼 사람이 없어 이렇게 글로 질문해봅니다.. ㅠㅠ

#nifH
 
#pcr
 
#qpcr
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리안재진  |  09.21 09:57  

정말 동정이 필요하시다면 국내 미생물 동정 서비스를 제공하는 기업들이 있습니다.

아무것도 없는 랩에서 계속할지 모르는 소무품과 장비를 구비해서 진행하기는 부담이 있을것 같네요.

교수님과 상의해서 동정 서비스를 이용하는것은 어떨까요?

꼭 하셔야 한다면 교수님께 관련 실험들을 배울수 있는곳을 섭외해 달라 해보세요. 교수님이시라면 후배 선배 혹은 동료들 중에서 실험을 가르쳐 줄만한 곳을 찾을수 있을것입니다.

알신군  |  09.21 18:08  

물론 필요하면 기업에 의뢰할 계획입니다ㅠㅠ 하지만 그전에 전체적인 프로세스에 대해 제대로 이해하고 싶어서 질문드렸습니다ㅠㅠ

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