실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
박테리아 실험(미생물 동정, PCR, qPCR)에 대해 질문드립니다!
레벨1 신군 (대학생)
박테리아 실험 관련해서 궁금한 것이 있어 이렇게 질문합니다... 이쪽 관련해서 아무런 지식이 없어 엄청 기초적인 것일 수도 있지만 부탁드립니다ㅠㅠ
1) 제가 16S rRNA의 염기서열 분석을 통해 토양 속에 있는 박테리아의 종류를 알아내려고 합니다만 16r rRNA염기서열 분석의 경우 균주?(strain)의 종류가 아닌 그 안에 속해 있는 박테리아의 종류를 알아내는 건가요?
2) 16S rRNA의 추출은 어떻게 하는 건가요? 이게 말이 RNA지 DNA를 추출해서 분석한다는 이야기를 본 적이 있는데 확실히 잘 모르겠습니다...ㅠㅠ 그리고 RNA든 DNA든 어떻게 추출하는 걸까요..ㅠㅠ
3) 제가 nifH 유전자를 qPCR을 통해 정량적 분석을 하고 싶습니다만 이 경우 토양에서 kit를 통해 추출한DNA를 그냥 사용하면 되는건가요? 아니면 그 DNA를 다시 질소가 없는 배지에서 배양한 뒤 콜로니를 생성한 박테리아만을 분석해야되는 건가요?
4) 만일 콜로니에서 생성된 박테리아를 분석할 경우 어떻게 추출할 수 있을까요...?ㅠㅠ
5) 아 그리고 앞서 말했듯 16S rRNA는 PCR을 통해 nifH 유전자는 qPCR을 통해서 분석할 예정입니다만 16S rRNA도 PCR기계가 아닌 PCR 분석장치로도 염기 서열을 분석할 수 있나요?
박테리아 관련된 연구실이 아니여서 어디 물어볼 사람이 없어 이렇게 글로 질문해봅니다.. ㅠㅠ
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