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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 PCR primer design에 대해서 알려주세요 ㅠㅠㅠ
알졸업반+새내기(대학생)  | 09.19 03:02
저는 ApE 프로그램을 사용하고 있습니다. PCR primer design 해보는걸 처음 하는데 너무 막막해서 올려봅니다 ㅠㅠ 제한효소 자리를 선정하고 insert부분을 선정해야하는데 제한 효소 자리와 겹쳐도 되나요 ? 당연히 ORF자리와는 겹치면 안되겠죠 ..? insert부분은 Tm값이랑 GC비율, 길이 고려해서 제가 sequence를 짜면 되는거 맞겠죠 ? ㅠㅠ 제발 도와주세요 ... 이것저것 찾아보면서 하는 중인데 정말 막막합니다. ...
#PCR
 
#primer design
 
#cloning
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리bio  |  09.19 21:18  

cloning용으로 사용하려는 것 같은데.

이 경우 XhoI이라고 하면 

AACC-XhoI-ATG----- 이런식으로 만들어 주면 됩니다 (frame 맞추어서).  

XhoI 밖에 extra로 몇개를 달아 주는 이유는 이렇게 해야 PCR이후 enzyme digestion이 잘 되기 때문입니다. GC 비율에 맞추어서 ATGC 넣어주면 됩니다. 

 

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