실험 Q&A Mol. Biol.-RNA > Small RNA Analysis
miRNA Real time PCR 결과 해석 질문입니다
레벨5 Qupi (대학원생)
안녕하세요
miRNA PCR을 처음 해보는데요ㅜㅜ
결과 해석에 어려움이 있어서 글을 올리게 됐습니다..
일단 PCR을 한 이유는 miRNA array를 하기 전에
RNA가 잘 뽑아졌는지 Quality를 확인하기 위함이었는데요
제가 사용한 샘플에서 잘 알려진 Reference gene이 없다보니
다른 논문들 보면 spike in control이라는 것을 사용하던데
일단 U6라는 Gene이 GAPDH처럼 사용이 된다고 해서
U6를 Target으로 Taqman방식으로 PCR을 진행하였습니다
그런데 결과를 보니 CT값이 각각 32, 37 이렇게 나오는데
찾아보니까 CT값이 30이 넘어가면 너무 높은 것이라고 하더라구요
그럼 이 샘플에는 U6라는 gene이 아예 없다라고 봐야 하는건가요?
일단 PCR을 해서 CT값을 측정하기는 했는데 PCR이라는게
찾아보니까 양을 알고있는 gene과 알고자 하는 gene의
CT값을 비교해서 양을 측정?(이게 델타CT?값이라고 하는 것 같은데 정확히 양을 계산하는 방식은 잘 모르겠습니다..) 하는 거라고 하는데
도대체 이번 실험에서는
이 CT값을 가지고결과 해석을 대체 어떻게 해야할지 도통 모르겠어서
질문 남깁니다...
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