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코로나바이러스 유연관계 분석에 관하여 질문이 있습니다...
레벨1 뷁 (일반인)
현재 유행하고 있는 SARS-Cov-2의 ORF1ab protein을 이용하여 기존의 coronavirus들과 유연관계 분석을 진행해보고자 합니다.
관련 정보를 찾아 보던 중 coronavirus를 크게 알파, 베타, 감마, 델타의 4가지 속으로 나누는 것을 알게 되었는데요. 유전체 서열에 따라 분류한다는데 정확히 나누는 기준이 무엇인지 궁금합니다.
또한, 유연관계 분석을 위한 기준으로 ORF1ab protein을 사용해도 되는지 궁금합니다. 저는 다른 coronavirus에 공통적으로 존재하는 것 중에 하나이고 중요한 역할을 하는 걸로 보여 이 단백질을 기준으로 선택하였는데요. 비교 서열을 이 단백질로 사용해도 문제가 없을까요? 보통 바이러스의 유연관계 분석을 하게 되면 어떤 단백질로 하나요?
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