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 전체 > Omics > Proteomics
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질문 발굴 샘플 수에 대한 통계적 근거
알박성준(과기인)  | 2020.09.11 17:50
대조군과 질환군 시료 각각 5개를 individual로 준비하여 tmt라는 질량분석 방법으로 동정하였습니다.

그래서 몇가지 단백질을 발굴하고 검증하여 논문을 서브밋 하였는데 리뷰어가 왜 발굴 시료가 저것밖에 안되느냐? 모집단에 대한 표본이 되는수치냐? 통계적 근거를 마련하라고 질문이 와서 고민하다가 글을 올려봅니다 . 혹시 이 부분에 대해서 관련 근거 (논문)에 대해 설명해 주실 귀인이 계신가요?
#통계
 
#단백질
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
tilldawn  |  2020.10.08    

대조군과 발현군 5개 혹은 각각 5개라고 해도

통계 처리하기에 전체 sample 수가 너무 적습니다.

관련 논문은 CPTAC에서 주로 많이 내고 있고

 

bing zhang이 낸 crc 논문도 80여개 sample을 준비한 걸로 알아요.

각 단백질 별로 t-test를 거쳤을 텐데, 각각 5개의 샘플에서 얻은 평균으로 비교를 하니 sample 수가 문제 될 수 있는 거지요. 분석을 추가 할 수 없다면 

scheffe 나 tucky같은 보수적인 방법으로 분석해서 defence 해볼 순 있겠네요 ㅠㅠ

 

행운을 빕니다

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