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레벨5
BlackSmile
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20.07.31 17:34
qPCR을 이용한 copy number measure의 모든 시작은 'genomic DNA의 copy number를 1로 가정한다'입니다. (그래서 보통 genomic DNA primer를 design할 때에는 gene상에서 copy number variation이 확인되지 않는다고 보고된 target site를 사용합니다)
genomic DNA의 copy number가 1일 때, mtDNA의 copy number가 얼마일지 비교하는 것이기 때문에, mtDNA의 Ct값과 genomic DNA의 Ct값의 차이를 구한 후(delta Ct), 2^(delta Ct)를 하면 그게 상대적인 Copy number가 됩니다.
예를 들어서, mtDNA에 존재하는 ND1 primer의 Ct값이 10이 나오고, genomic DNA의 Ct값이 22가 나왔다고 하면 2^(22-10) = 4096를 상대적인 copy number로 계산할 수 있습니다.