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레벨5
BlackSmile
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20.07.31 16:24
Actin이나 GAPDH와 같은 Housekeeping gene에 대해서도 qPCR을 진행하셨을텐데, 여기서는 Ct값이 개체마다 일정했었나요?
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12345
(비회원)
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20.07.31 17:00
개체마다 달라질 수 있지요.
문제는 housekeeping gene (control gene) 에 비해
얼마나 나오느냐 입니다.<br />
RNA quality 를 체크해 보시기를 추천합니다
(nanodrop, agarose GE.)
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레벨1
Yjn
(대학원생)
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20.07.31 23:23
Actb와 gapdh 에서는 3가지의 개체가 19에서 20사이로 어느정도 일정하게 나왔습니다.
하우스키핑유전자 17개로 ct값을 보고있는데 모든 유전자가 한개의 개체에서만 다 낮게나오는게 아니라 다른 유전자들은 비슷한 경향성으로 나오지만 몇개는 저렇게 차이가 나게 나오더라구요.
RNA 퀄리티는 괜찮았는데 cDNA 합성과정의 문제인지 프라이머의 문제인지 농도의 차이인지 개체의 특이성인지 다시 재실험을 해 볼 예정이긴 합니다..
Trizol-based total RNA extraction 이면 이런 경우가 종종 생깁니다.