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효소 정보를 보면 이 단백질은 2개 domain으로 되어 있고 mature가 62번
아미노산 부터입니다.
따라서 signal은 61번 아미노산, 183번 염기까지입니다.
primer는 ATG + 184번 염기 부터 만들면 됩니다.
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(대학생)
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20.07.28 15:44
감사합니다. 위의 사이트에선 그림과 같이 아미노산 30번 전까지 짤라내면 된다고 하는 것 같은데, 이는 정확하지 않은 건가요?
처음 질문에 gene 이름을 물어본 것은 연구가 된 단백질인지 연구가 아직 되지
않은 단백질 인지 확인하기 위해서입니다.
연구가 되었는 단백질은 단백질 정보에 나와있는 것이 정확한 내용입니다.
연구가 signal쪽으로 아직 안되어 있다면 program으로 예측할수 밖에 없습니다.
이 단백질은 연구가 되어 있는데 무시하고 프로그램으로 예측하는 것은
의미가 없습니다.
62번 아미노산 부터 mature이기 때문에 이 결과에 따라 primer를 만들어 PCR하면
됩니다.
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레벨2
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(대학생)
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20.07.28 17:29
아직 모르는게 많은 저에게 한 줄기의 빛이 되어주셔서 감사합니다ㅠㅠ
공부 열심히 하겠습니다!
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레벨2
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(대학생)
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20.07.28 18:11
혹시 마지막 질문 가능할까요...
region - cellulase 클릭하였을 때, 아미노산 서열 62번부터 색이 들어오는데
그렇다면 앞쪽이 전부 signal peptide인건가요. 아님 불필요한 서열도 포함되어 있는건가요.
앞쪽 도메인이 62번 부터이기 때문에 61번 까지는 3차 구조를 형성하는데
필요하지 않은 부분입니다.
최종 mature form에 62번 앞쪽 아미노산이 붙어 있다면 3차 구조에 영향을
줍니다.
이런경우 앞쪽 도메인의 영역이 62번 아미노산 앞부분을 포함해야 합니다.
따라서 61번 까지는 떨어져 나가는 부분입니다.