실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
gag pol primer서열
레벨2 ㄱㄴ (대학원생)
안녕하세요
첫학기 대학원생입니다.
이번에 제가 프라이머를 주문해야 하는 일이 생겼는데 주위에서 도움을 받지 못해 이렇게 질문을 남기게 되었습니다.
(제가 생명쪽 전공이 아니다보니 완전 처음부터 공부중이라 양해부탁드려요ㅠㅠ)
제가 주문해야할 primer/probe는 레트로바이러스를 감염시킨 293T cell을 detect하기 위한 것입니다.
293T cell을 다른 cell에 감염시켜서 그 세포안에 293T cell이 남아있는지를 확인 하는 것입니다.
여기서 gag와 pol을 detect해서 이것들이 없다면 293T cell이 없다는 것으로 결론을 내는게 이 실험의 목적입니다.
제가 궁금한건, gag와 pol이 워낙 긴 서열을 가지고 있고, 많기 때문에 primer를 어떻게 선정하면 좋을지입니다 ㅠㅠ
찾아보니 HIV1의 gag pol도 있고, 다른 여러 세포에서 gag pol이 더라구요. 세포가 달라도 gag와 pol의 서열이 비슷한 것인가요?
아니면 293T에 있는 gag 와 pol만 선택해야 하는 것일까요?
벡터에 따라 gag와 pol의 서열이 달라지는건가요?
(293T에 있는 gag와 pol의 염기서열 자료는 아직 찾지 못했습니다 ㅠㅠ)
gag와 pol처럼 긴 염기서열을 가진 것에서는 primer를 어떻게 선정하시는지 노하우도 듣고 싶습니다.
답변 주시면 정말 감사하겠습니다 ㅠㅠ 좋은 하루 되세요!
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