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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
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질문 Real time PCR 결과계산 중 간단한 질문이 하나 있습니다.
올챙이dmgk(대학생)  | 07.13 03:46
안녕하세요 초보학부실험실생입니다.
Real time PCR결과계산중에 질문이 하나 있습니다.
계산결과
∆Ct control 이 -9정도
∆Ct (sample)이 1정도로
∆∆ Ct = ∆Ct (sample) – ∆Ct Control = 10이 나오게 되어서
제가 확인하려는 목적 유전자의 발현이 sample처리후에 (처리전과 비교하여) 2의 마이너스 10승인 0.0009배 더 많이 발현되었다는 결과가 나왔습니다.
(제가 가해준 sample은 염증을 유도하는 것으로 목적유전자는 염증관련유전자입니다.)
실험도중 값이 튀어 잘못된 실험인 것 같습니다만


!!!제가 궁금한 것은 ∆∆ Ct 이 양수가 나오게되면 무조건 sample처리 전보다 sample처리후에 목적유전자 발현양이 더 적어졌다고 생각할 수 있나요?
아니면
2의 ∆∆ Ct 승 으로 나타내어 'sample처리후 x배 더 많이 발현되었다'라고 표현한다면 x값이 1보다 아래인 경우에 이렇게 생각해줄 수 있나요?

허접한 질문이지만 답변부탁드립니다.
# RT-PCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
조교  |  07.13 13:46   

식생공이신가요..? B3조 B4조 비교하시는거 같은데

아마B4조 LPS 실험 값이 튀어서 그렇게 나온거 같습니다

원래 TNF-a가 ct값이 더적어야하거든요 ㅠ

지나가다..  |  07.17 12:55   

데이터 중에 

∆Ct control  = -9

∆Ct (sample) = 1

이게 잘못된거 같은데요? 

 

∆Ct=Target gene Ct value -HouseKeeping gene Ct value 입니다. 

∆Ct control의 값이 -9가 나왔다는건 Target gene의 유전자 발현 빈도가 

House Keeping gene 대비 512배가 높다는 이야기인데, 이런 유전자는 흔하지 않은데요... 반대로 반대로 하신거 아닌가요? 위에께 +9고, 아래께 -1이어서 총 계산하면 2^-10이 되고, Positive와 처리 샘플의 차이는 1024배가 난다.. 

 

보통 이런경우가 많죠.. 

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