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intact gDNA를 추출하기 위해서입니다.
1개는 vortexing, 1개는 inverting해서 추출해보면 이유를 정확히 알수 있습니다.
저는 보통 gDNA 추출을 mitochondrial DNA copy number 해석을 위해 했어서
Proteinase K단계에선 vortexing(mild, 5 sec) 을 하는데요
실제론 Proteinase K단계에선 Mild한 vortex(5초정도)을 manual에 올려둔 kit도 많습니다.
물론 당연하겠지만 실험목적이
온전한 gDNA extraction을 원한다면 피하는게 좋다고 생각합니다.
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레벨5
CHINyo76_philekorea
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20.06.16 14:41
column 방식의 genomic DNA extraction kit을 사용하여 조심스럽게 추출을 진행하더라도 대부분 50Kb 이상의 크기로 추출하기 어렵습니다.
그런데 gDNA 추출 시 vortexing이나 tapping을 하게되면 물리적인 힘으로 인해서 High molecule인 gDNA는 조각날 수 밖에 없을겁니다.
그리고 물리적인 힘에 의해 조각나는 것을 조금이라도 줄이기 위해서 micropipette tip도 끝 부분을 직경 약 2-3 mm 가 되도록 잘라내어 사용했습니다.