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NCBI 서 whole genome shotgun으로 쪼개져 있는 파일로 완성된 whole genome FASTA 파일 만들수 있나요?
레벨2 ㅁㅁㅈㅈ (대학생)
NCBI서 보면 어떤 종 유전자는 whole genome sequence가 온전하게 있어서 바로 fasta 파일을 받을수 있는데 어떤 놈들은 whole genome shotgun sequence만 몇개씩 있고 그걸 다 모아둔듯한 whoe genome shotgun project라는 항목에는 FASTA 파일은 받을 수 없고 genbank 파일만 얻을 수 있었습니다.
이걸로 온전한 whole genome sequence fasta파일을 얻으려면 프로그램을 써야 하나요? 검색해보니 바이오파이썬을 사용한다 vector NTI를 사용한다 답변이 여러가지라서 어느게 정답인지 모르겠습니다. NCBI서 어떤 파일을 받아서 어떤 프로그램을 돌려야 하는지 답을 좀 알려주십시오.
그리고 혹시 파일을 이렇게 어렵게 파이썬까지 돌려가면서 열어야 한다는건 그만큼 NCBI서 이 종의 full sequence를 공개하지 않기 위함일까요?
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