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질문 NCBI에서 Annotation이 완료된 경우
알glow216(대학생)  | 06.05 10:40

 

Bioinformatics 공부하는 학부생입니다.

NCBI의 Genbank에서 Annotation이 완료된 대상을 찾아야 하는데

Annotation이 완료되었다는 것을 무엇을 보고 알 수 있는지 궁금합니다!

제가 초보라서 자세히 답해주시면 감사하겠습니다!

 

#NCBI
 
#Genbank
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
꽃개구리느림보  |  06.06 00:09  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

연구자가 등록한 genome annotation은 NCBI에서 자체적인 pipeline을 거쳐서 검증된 버전인 RefSeq으로 다시 등록됩니다. 이것은 또 genome 페이지에 여러 비교정보들과 같이 정리되어 있습니다. 

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/browse#!/eukaryotes/

아래 표는 진핵생물들만 선택한 후에, Assembly level을 'Complete'로 필터한 결과 39종을 나타낸 것입니다. 이 표에서 annotation의 정도를 "Level"컬럼의 파이그래프로 평가되어 있습니다. 여기서는 Complete만 선택했으니까 다 까만색입니다. 

upload_image

 

 

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