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질문 WGA 산물을 Nanodrop하는 방법이 무엇인가요?
알송인준(대학생)  | 05.27 18:48

안녕하세요, 식물 유전 분야에서 석사과정을 준비중인 학생입니다.

WGA 산물을 Nanodrop하는 방법을 여쭙고자 이렇게 질문을 남깁니다.

 

Nanodrop을 할 때, 처음에 영점을 잡게 되는데

WGA의 경우 이 영점을 어떤 Buffer를 이용해야 하는지 궁금합니다.

(매뉴얼에 안나와있고, 찾아봐도 정보를 얻기가 힘들어서요 ㅜㅜ)

 

WGA 과정에서는 Qiagen의 REPLI-g Mini Kits를 이용하였습니다.

#WGA
 
#PCR
 
#Nanodrop
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
꽃개구리느림보  |  05.28 07:10  
증폭한 핵산 반응용액이기 때문에 UV흡광을 바로 찍으면 안되겠죠. 또 컬럼으로 정제하면 분포가 편향이 생겨날 수 있으니 감안해야 할 것이구요.
우선은 1ul만 열배 정도로 TE 버퍼에 희석시키고 찍으면 대강 짐작이 될 것 같습니다. 그런데 프라이머가 들어 있기 때문에 증폭된 DNA만 선택적으로 보기 위해서는 dsDNA에 결합하는 형광시약을 쓰는 것이 좋을 것 같습니다. PicoGreen을 쓰면 되겠네요.
지나가다..  |  05.28 13:05   

증폭된 산물을 그대로 Nanodrop으로는 못찍습니다. 

찍을수있지만 정확하지 않구요. 각종 primer나 polymerase dNTP등이 둥둥 떠다니는 상태입니다. 결과가 매우 부정확하죠.

그래서 이럴때는 형광으로 측정해야 그나마 결과가 정확합니다. 나노드랍이 아닌 Qubit과 같은 장비를 쓰는거죠. 

 

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