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 전체 > Molecular Biology-RNA > Purification/Isolation
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질문 RNA를 뽑았습니다. 왜 자꾸 이런현상이 나올까요...?
개구리Cndida Girl(대학원생)  |  05.19 19:48

Trizol을 이용해 RNA를 추출했습니다.

28s 18s로 추정되는 밴드는 잘 보이는듯합니다.

그런데 디그라데이션된 밴드가 엄청 많네요.

컨탐된걸까요? 모두 오토돌렸고 Ultra pure water사용했습니다.

급한대로 1%짜리 Agarose gel에 2ug로딩하여 200mA로 20분러닝해서 핸드폰카메라로

촬영했습니다.

upload_image

#RNA
 
#degradation
 
#contamination
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개구리무광  |  05.19 21:06  

애초에 autoclave로는 RNase 불활성화/제거가 어렵습니다.
 

대왕개구리SPEED  |  05.19 22:29  

RNase가 주변에 항상 존재하지 않고 분리는 어느정도 잘된것 같습니다.

전기영동은 항상 빨리 내리면 안좋습니다.

첨부 사진에 나온 거리를 30분~40분 정도 걸려서 내려 보세요.

대왕개구리강시  |  05.20 09:13  

RNA degradation이 심하면 28S rRNS가 빨리 없어집니다.

사진으로 보면 28S가 18S 에 비해서 양이 많아 보이므로 degradation은 거의 없는 것으로 보입니다.

이 사진은 아직 dye가 다 빠지지 않아서 28S rRNA의 양이 정확히 보이지 않습니다. dye가 더 위로, 28S rRNA 위로 다 빠질 정도로 run해 보면 좋은 사진이 나올것 같습니다.

지나가다..  |  05.21 14:10   

원래 저렇게 나옵니다.

잘나온거에요. 

Degradation 되었으면 18s/28s부터 희미해집니다. 

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