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PFGE 장비를 data sheet에 사용한 것과 동일한것을 사용했나요?
pluse가 정확히 안걸린것 같이 보입니다.
well에도 DNA가 상당히 많이 남아있구요.
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레벨2
궁금합니당
(과기인)
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20.05.13 16:18
pulse time을 동일하게 했는데 혹시 pulse가 안 걸린 것 같다는 건 어떤 말씀이신가요?
정상적으로 내려 갔다면 well에도 DNA가 남아있지 않고 band도 분리되어서
나왔을겁니다.
젤의 제일 아래쪽을 보세요.
밴드가 보이죠?
작은 밴드는 보이는데 큰 밴드는 분리가 안된것으로 보입니다.
혹시 연구실에 다른 high-molecular weight PFGE 마커가 있으면 같이 걸어 보세요.
사진에 보이는 마커는 이스트 크로모좀 마커로 보이는데 아가로스의 종류에 따라 밴드분리가 되기도 안되기도 합니다.
어떤 아가로스를 사용하셨나요?
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레벨2
궁금합니당
(과기인)
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20.05.14 09:17
biorad의 pulsed field certified agarose 1%로 사용하였습니다.
가지고 있는 다른 marker는 없고
certified megabase agarose는 있습니다.
아무리 봐도 마커가 degradation된것 같습니다.
만일 0.5X TBE 대신 0.5X TAE를 사용해서 같은 현상이 나오면 마커가 degradation된것으로 판단해도 될것입니다.