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특정 sequence내에 존재하는 known motif 찾기
레벨1 BioInformatics (과기인)
안녕하세요.
제가 가지고 있는 특정 sequence내에 어떠한 known motif가 존재하는지 탐색할 수 있는 툴이 있을까요(novel motif는 아닙니다!)?
MEME는 novel motif만 찾아주기에 큰 도움이 되지는 않았습니다. JASPAR나 HOCOMOCO등에 존재하는 known motif의 sequence와 일치하는 motif들을 제가 가진 sequence내에서 찾아내고 싶은데 방법이 있을까요?
PWMscan의 경우는 해당 gene을 일일이 선택해야해서 불편함이 있었습니다 ㅠㅠ
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