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 전체 > Molecular Biology-RNA > Small RNA Analysis
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질문 miRNA qRT-PCR 질문
알ecosci(대학원생)  |  04.09 20:39

안녕하세요.

최근에 miRNA work을 하게 되었는데요.

mRNA expression을 확인하기 위한 qPCR을 자주해본 경험이 있는데

miRNA expression을 본적은 한번도 없어서 문의드립니다.

 

miRNA는 일반 total RNA isolation과는 다르게 TRizol 이용시 효율이 떨어진다고 들어서 전용 isolation kit를 이용할 계획입니다.

 

찾아보니 mirVana kit를 많이 사용하는 것 같아서 이것으로 이용할 계획인데요.

 

문제는 miRNA을 extraction했다고 했을 때 cDNA synthesis를 해야하는데,

기존에는 mRNA를 이용했기 때문에 polyA tail에 붙는 oligodT를 이용해서 cDNA를 만들었는데, miRNA는 이 방법대로 하면 안될 것 같아서요.

 

논문들을 찾아보니, TaqMan™ Advanced miRNA cDNA Synthesis Kit (#28007)를 많이 사용하는 것 같은데, TaqMan이라서 써도 될까 잘모르겠네요 ㅠㅠ

 

저는 qRT-PCR을 SYBR green으로밖에 안해봐서 miRNA 실험도 SYBR green으로 할 예정인데요.

Taqman probe를 이용하지 않을 경우에도 Taqman cDNA synthesis kit를 사용해도 될지 궁금하여 문의드립니다.

 

답변은 미리 감사드립니다.

#cDNA
 
#miRNA
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