실험 Q&A Microbiology > Bacteria
NCBI gene 및 product 검색
레벨1 공 (대학원생)
안녕하세요 NCBI 사용법에 대해서 조금씩 알아가고 있는 석사 1학기생입니다..
2017-Genomic insights into the virulence and salt tolerance of Staphylococcus equorum 의 논문에서 나온 Beta-hemolysin gene을 찾고있는데요.
위 사진에서 블록처리된 AVJ22_RS14095을 찾고싶습니다.
Locus tag 인건 알겠는데 NCBI에서 Hemolysin 관련 유전자는
CDS complement(1..684) /locus_tag="AVJ22_09405"
위와 같이 AVJ22_ 까지만 일치하고 제가 찾고싶은 RS14095는 찾아볼수가 없습니다.. ㅜㅜ
*표시는 plasmid에 위치한다고 하여서 Replicon의 chromosome이 아닌 plasmid에서 검색을 해봤는데
plasmid에서도 마찬가지로 AVJ22_ 뒤에 영문이 아닌 숫자만 나옵니다..
그래서 결론은
1. Locus tag의 AVJ22_ 및 RS14095의 의미가 있는지?
2. 다른 방향으로 gene을 검색할 방법이 있는지?
가 궁금합니다.
도움 부탁드립니다..ㅜㅜ
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