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 전체 > Molecular Biology-RNA > Small RNA Analysis
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질문 Internal control이 exogenous로 따로 넣어줄 경우
알diamedi(과기인)  |  04.03 19:03

Internal control이 exogenous와 endogenous로 나뉨 (참고: https://www.qiagen.com/ca/spotlight-pages/newsletters-and-magazines/articles/correct-interpretation-negative-results)

eature  Exogenous homologous  Exogenous heterologous Endogenous 
Universal use in multiple assays    ✓  
Serves as control for purification procedure  ✓  ✓  ✓
Differentiates purification errors from amplification errors  ✓  ✓  
Template quantities are defined and consistent  ✓  ✓  
Non-competitive internal control design    ✓  ✓

Exogenous IC가 두가지:위 링크에 따르면:

1> homologous IC, targeted pathogen sequence와 같은 primer binding sites 가짐->an artificial template로 작용

target과 IC에 같은 프라이머를 쓰지만, sequence가 달라, 다른 프루브를 사용-pathogen과 IC amplicons 구분 가능.

 

2> Heterologous ICs:designed with their own primers and probe가 pathogen과 아예 binding site가 다름.

-allow for a design and setup that prevents competition for PCR components

-universal controls

 

-> 이에 따르면 human housekeeping gene과 동일한 gene에 대한 exogenous internal control은 넣어줄 필요가 없고, 오히려 농도가 높으면 PCR 반응을 저해하는게 맞나요>

#PCR
 
#internal control
 
#housekeeping gene
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