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- 다른 plasmid에 seq을 찾아보니 어떤 경우에는 c가 하나 더 있는 경우도
있었습니다
: 따라서 원래 서열은 C가 몇개인가요?
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레벨2
SpongeBob
(과기인)
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20.03.27 19:41
NCBI에 등록 되어 있는 서열은 제가 노란색으로 색칠한 부분의 C가 0개 혹은 1개 있는 서열이 등록되어 있습니다.
그런데 제가 cloning해서 읽은 서열은 C가 2개 있었습니다. 크로마토그램을 봐서는 seq 에러는 아닌듯 합니다.
이 promoter를 유전자 발현에 사용 시 크게 문제가 될까요?
NCBI 등록 번호가 어떻게 되나요?
promoter 구조를 분석해 보고 서열이 엄격히 지켜지는 부위인지 아닌지 보고
예상 가능할것 같습니다.
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레벨2
SpongeBob
(과기인)
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20.03.29 16:38
감사합니다.
NCBI에 등록된 ubiqutin promoter 서열은
LC506529.1 의 133-2125 서열입니다.
Promoter 분석을 통해 그 부분이 엄격하게
서열이 지켜지는 부분인지 아닌지를 어떻게 알 수 있는지 좀 알려주실수 있나요?
감사드립니다.
vector의 133bp는 ctgcag인데 질문에 있는 서열은 ggggga로 시작합니다.
첨부 서열의 어디가 promoter 시작 서열인 ctgcag 인가요?
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레벨2
SpongeBob
(과기인)
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20.03.30 08:41
NCBI 링크의 1131번째 서열부터 "c"가 13개가 나옵니다.
그런데 제가 실제로 PCR로 떠낸 서열은 "c"가 15개가 나왔습니다.
그래서 이것을 사용해도 괜찮은지 질문 드립니다.
감사합니다.
첨부 서열의 구조를 파악하기 위해서 질문을 했는데 다른 답변이 올라왔네요.
promoter 구조 분석은 안될것 같고 현재 문제가되는 C는 promoter 부위가
아닙니다.
발현에는 관계없는 부분인데 그 부분까지 사용하는 이유가 있을까요?