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질문 BLAST에서 아미노산 서열을 검색할 때 정확하게 일치하는 서열을 검색하는 방법 좀 ㅜㅜ
알민구차(일반인)  |  03.19 14:03

안녕하세요. 

처음으로 질문을 남겨봅니다. 

BLAST를 이용해서 서열을 검색할 때 

Query sequence에 검색하고자 하는 서열을 입력하는 제가 입력한 서열과 가장 유사한 서열을 포함하는 단백질 정보가 검색이 됩니다. 

그런데, 제가 검색을 하고 싶은건 예를 들어 10개의 아미노산 서열로 이루어진 펩타이드 단편을 검색했을 때 그 10개의 아미노산 서열과 동일한 서열을 포함하는 펩타이드 또는 단백질을 확인하고 싶은게 아니고, 정확하게 그 10개의 아미노산 서열로 이루어진 펩타이드 단편이 공개되어 있는지 확인하고 싶습니다. 

혹시 이런 검색은 불가능한 것인지요?

아니면 가능하다면 어떻게 하는건지 설명 부탁드립니다ㅜ

답변에 미리 감사드립니다!!

#BLAST
 
#서열분석
 
#아미노산
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  03.19 14:24  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

Blast에서 검색하면 질문과 같은 결과가 나오고 결과 중에서 원하는 결과를

도출해야 합니다.

peptideatlas에서 한번 검색을 해보세요.

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