실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
발그런님 NCBI
NCBI초보 (비회원)
안녕하세요? 제가 NCBI에서 human genome 중에 10 or 5kb정도되는 길이의 PCR 산물이 나오는 primer를 제작하려고 합니다. Template에는 D1S80 이라는 GAGGACCACCAGGAAG 16bp의 microsatellite marker가 포함되어야 하구요. 그러니까 D1S80 부분이 포함된 template를 써서 PCR을 돌렸을때 5kb나 10kb길이의 DNA가 만들어져야 합니다. 그런데 제가 NCBI사용법을 배운적이 없어서 template를 설정하는것부터 어렵네요. D1S80을 검색하니 1번 염색체에 포함된 것이라는건 알겠는데 이것이 포함된 nucleotide를 클릭하니 길이가 대체로 650bp정도밖에 되지 않습니다. 이 microsatellite가 포함된 부분의 앞뒤 염기서열은 어떻게 찾으면 되는지. D1S80을 포함하며 길이가 11kb정도 되는 template를 정하고 5kb나 10kb정도가 되게 primer를 제작해야 하는데 어떻게 할지 잘 모르겠네요. 그리고 primer를 제작하고 나서 이 primer가 다른 부분에 반응하지 않는다는 것도 확인해야 하고요.ㅡㅡ 그런데 이렇게 제작한 primer을 배양한 cancer에서 DNA를 뽑고 pcr을 돌려도 괜찮을까요?
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