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 전체 > Molecular Biology-Protein > Western Blot Analysis
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질문 같은 단백질을 보는 antibody 인데, target 하는 kDa가 다른이유...
올챙이써니22(대학생)  |  02.28 14:51
안녕하세요, 석사를 마치고 연구원으로 연구를 하고있는 사람입니다. 
 
lab에서 western blot을 자주 하고있는데요,
 
collagen1,3를 test하는데 계속 data sheet 와 다른 kDa에서 band가 뜹니다. 
(data sheet는 130kDa로 나와있는데, 100kDa에서 예쁜 band가 뜹니다.)
 
다른 논문이나, 항체들을 보면 100kDa에 collagen 항체가 있던데...
 
왜 같은 단백질을 detect하는데 band가 뜨는 위치가 달라질까요?
 
P.I 께서는 논문을 찾아보라고 하는데...
 
저는 data sheet가 가장 정확하다고 생각이 되어서요, 논문에서 다 같은 항체를 쓰
 
지는 않으니...
 
간단한 질문일수도 있지만, 여쭤볼 곳이 마땅치 않아 이렇게 질문 올립니다. 
 
감사합니다!   
#Western blot
 
#protein
 
#antibody
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개구리절대교주  |  02.28 16:15  

같은 단백질이라도 이성질체가 존재할 수 있고, 종마다 조금씩 길이가 달라 밴드의 위치가 달라질 수 있습니다.

데이터시트에서 쓴 종과 웨스턴으로 본 종이 완전히 일치하는지, 그리고 어떤 진을 잡는지 데이터 시트를 봐서 해당 ID를 NCBI에서 찾고 단백질 시퀀스를 찾아서 그 시퀀스의 kDa을 확인하는 방법도 있겠네요.

제가 콜라겐은 잘 모르겠는데 데이터 시트와는 다른 경우가 의외로 많습니다. 그래서 괄호치고 (obseved) 였나? 실제 보이는 밴드 위치를 따로 표기하는 경우도 있답니다.

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