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 전체 > Molecular Biology-Protein > Extraction/Isolation
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질문 부분 정제된 저분자 펩타이드의 분석을 하려고 합니다
알감귤참새(대학원생)  |  02.17 23:07

제 sample은 7kDa 이하로 추정되는 작은 peptide이고,

C18 을 거쳐 anion exchange chromatography를 통해 부분 정제된 상태입니다.

 

peptide의 구조나 시퀀스를 분석하려하는데 제 sample이 trypsin, proteinase K, pepsin 으로는 분해되지 않습니다. 

MALDI-ToF 나 N-terminal seq을 맡겨봤지만 위의 이유로 실패하였고, 더구나 현재로서는 완전히 정제된 상태가 아닌지라 다른 단백질이나 peptide가 섞여있는 상태일 가능성 또한 배제할 수 없습니다.

peptide가 맞는지 조차 확신할 수 없어서 amino acid analysis를 맡기려 했으나, 이 역시 부분 정제된 시료의 경우 분별력이 없기 때문에 추천하지 않는다고 하십니다....

 

이런 경우 어떤 실험법으로 분석을 해야하는지 도와주시면 감사하겠습니다.. ㅠㅠ

LC/MS 로 분석하는 경우도 있는 것 같던데, 부분 정제된 시료로도 충분히 분석이 가능할지 궁금합니다.

완벽 정제하기에 어려움이 있어서 어느정도 구조 분석을 하려했는데, 그러려면 정제가 필요하고... 굴레에 빠졌습니다 도와주세요ㅜㅜ

#peptide
 
#펩타이드
 
#분석
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  02.17 23:38  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

완전 정제를 우선 해보세요.

정제를 위해서 지표가 있을 건데 물질 정제가 생각보다 어렵지 않습니다.

그리고 정제하기가 힘들면 부분 정제된 시료라도 원하는 peak를 알면

LC-MS나 LC-MS/MS에서 구조 분석 가능합니다.

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