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 전체 > Molecular Biology-RNA > mRNA Analysis
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질문 gene과 mRNA
올챙이사시루(과기인)  | 02.15 23:14

최종 목적은 새로운 유전자를 찾아 식물에 형질전환 하려고 합니다.

논문에 밝혀진 arabidopsis 유래 유전자를 NCBI에 검색을 하였고, 그 유전자를 blast를 통해서 제가 원하는 식물종에서 mRNA가 비슷하다는 것을 확인하였습니다.

제가 원하는 식물종은 full 시컨싱이 되어있는데 유전자 기능은 밝혀지지 않았습니다. 그래서인지 blast 결과 원하는 종에서는 mRNA가 검색됩니다.

그런데 mRNA에서 염기서열을 orf 영역을 확인하였는데 짧은 엑손부분과 인트론 그리고 긴 엑손 부분이 있습니다.  mRNA는 엑손만 존재해야되는데 왜 인트론 부분도 있는거죠?

유전자 기능을 알려면 형질전환 해야되는데 그러면 어떻게 해야되는지 궁금합니다.

 

#mRNA
 
#gene
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  02.15 23:45  

mature mRNA 서열이 아니라 pre-mRNA 서열을 찾은건 아닌가요?

사시루  |  02.16 13:36   

mature와 pre는 구별 가능한가요? mRNA라고만 되어있어서요.

꽃개구리느림보  |  02.17 08:19  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.
보통 genome 상의 gene annotation에서 mRNA는 transcript의 시작과 끝 영역으로 정의합니다. 그 영역에 포함된 서열 전체가 mRNA가 아니라 mRNA 영역이라고 이해하면 될 듯 하네요. 엑손 인트론 구조는 transcript 여러 isoform들 중에서 구조가 맞는 cds를 찾으면 되겠죠.
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