우선, 나노드랍으로 dNTP 가 잔뜩 섞여있는 mixture에서 PCR product만 나노드랍으로 측정가능한가요..? 그 부분은 저도 몰라서.. 혹시 아시는 분 있으면 저도 알려주세요. 잠깐 찾아봤는데 모르겠네요.
제가 아는것만 의견 드리겠습니다. 정확하지 않으니 교수님또는 실험방 선배와 상의하셔서 해결하심이 좋겠습니다.
1. 정확한 농도 측정이 필요없으시다면 그냥 serial dilution하셔서 고농도에서부터 저농도까지 qRT-PCR 돌려보면 됩니다. 원하는 적당한 농도 range를 잡으실 수있습니다. 이럴 경우에는 5-fold 또는 10-fold serial dilution으로 진행합니다.
2. agarose gel 전기영동해서 밴드의 두께와 진하기로 얼추 농도를 가늠해볼 수 있습니다. 물론 size marker 또는 정확하게 농도를 알고있는 DNA 와 비교하여 대략적 측정이 가능합니다. (절대 신뢰는 불가하나 어느정도구나~ 할 수 있습니다) 프로그램 쓰셔서 intensity 측정하면 더 정확합니다.