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레벨3
tjioo;
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20.02.16 08:53
nanodrop으로 RNA, DNA 다 농도 잴 수 있는데 왜 cDNA라고 안된다고 들으셨는지요? option을 DNA로 맞추고 ssDNA인지 dsDNA인지 option을 맞춰서 재시면 됩니다.
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레벨5
지나가는사람
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20.02.16 11:06
ss DNA 항목으로 측정하시면 됩니다 ^^
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cDNA
(비회원)
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20.02.18 07:04
RT후 cDNA 농도는 별도의 purification을 하지 않는다면 잴수가 없습니다.
그냥 RNA 농도랑 같다고 생각하시고 실험 진행하시고, 혹시 문제가 있다면 qPCR결과 토대로 보정하는 것이 좋겠죠.
저도 측정이 안되는걸로 알고있는데 다들 정확한 정보 맞나요?
우선, 나노드랍으로 dNTP 가 잔뜩 섞여있는 mixture에서 PCR product만 나노드랍으로 측정가능한가요..? 그 부분은 저도 몰라서.. 혹시 아시는 분 있으면 저도 알려주세요. 잠깐 찾아봤는데 모르겠네요.
제가 아는것만 의견 드리겠습니다. 정확하지 않으니 교수님또는 실험방 선배와 상의하셔서 해결하심이 좋겠습니다.
1. 정확한 농도 측정이 필요없으시다면 그냥 serial dilution하셔서 고농도에서부터 저농도까지 qRT-PCR 돌려보면 됩니다. 원하는 적당한 농도 range를 잡으실 수있습니다. 이럴 경우에는 5-fold 또는 10-fold serial dilution으로 진행합니다.
2. agarose gel 전기영동해서 밴드의 두께와 진하기로 얼추 농도를 가늠해볼 수 있습니다. 물론 size marker 또는 정확하게 농도를 알고있는 DNA 와 비교하여 대략적 측정이 가능합니다. (절대 신뢰는 불가하나 어느정도구나~ 할 수 있습니다) 프로그램 쓰셔서 intensity 측정하면 더 정확합니다.