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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
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질문 Taq종류에 따라서 나오는 PCR 결과가 상이할 수 있나요??
알soonlok(대학생)  |  01.16 11:30

현재 클로닝하기 위해 PCR을 진행중입니다.

같은 DNA, 프라이머에 같은 PCR cycle로 맞추고

다른건 Taq이랑 맞는 버퍼들 밖에없거든요

그런데 지금 Bio taq에서는 밴드가 선명히 잘 나오는 반면

Ex taq에서는 얇게 나오고 pfu taq에서는 밴드가 나오지 않습니다. 

이런 경우에는 어떤것이 문제라고 봐야할까요 

#cloning
 
#PCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
1  |  01.16 13:47   

Taq마다 PCR 활성 조건이 달라서 결과가 다를 수 있을 거 같습니다.

 

제품 메뉴얼에 있는 PCR cycle 정보를 확인하시고 비교해보시기 바랍니다.

꽃개구리Applied_Microbe  |  01.16 14:45  

PCR 온도조건이 어떤지 모르겠습니다..... PCR target size와 polymerization 시간간의 상관관계 문제일 수도 있을 것 같구요  ....  DNA polymerase의 품질 유지상태도 확인해야할 것같구요...

Pfu DNA polymerase의 경우는 proof reading의 기능이 있어서 좀 느리게 합성될텐데요... (PCR product에 polyA tail도 없을거고요) 그래서 다른 두가지 Taq과 는 다르게 나온거 같네요....

개구리캐틀  |  01.16 14:58  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

네. 사용하는 taq polymerase 및 buffer에 따라 결과는 달라질 수 있습니다.

primer, template, PCR 장비는 그대로라 하더라도 polymerase의 종류가 달라지면 조건을 다시 잡아야 할 수 있습니다.

taq 종류 뿐만 아니라 각 회사에따라 결과가 달라질 수 있어요예를들어 A사 taq에서 잘 나오는것이 B사 taq을 사용 했을때 결과가 잘 안나오는 경우 같이..

그런걸 흔히 primer와 궁합이 잘 안맞다고 표현을 하는데...

그럴것이 각 taq의 역할이나 기능도 다를것이고 buffer의 각 물질의 농도에 따라서충분히 달라질 수 있기 때문이죠..

 저의 경험으로는 PCR장비에 따라 결과다 다르게 나오는 경우도 있었어요.

PCR진단제품개발 할 때 개발다하고 다른 회사릐 PCR 장비를 사용햇더니 결과가 안나오는 경우도 있었거든요. 그 이규가 증폭 target에 따라 다르긴할 텐데...PCR 장비의 온도 상승 속도가 개발당시의 제품의 속도보다 너무 빠르거나, 혹은 너무릴 경우 결과 미스메치가 발생하는걸 겪었거든요...

 

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