[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 sale 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
검색광고안내
과학기술용어에 대한 과기인 인식조사
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-RNA > etc.
조회 4087  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 간암 세포 cell line에서 qRT-PCR 결과 cell line별로 peak이 달라요
알ymk8028(대학원생)  | 01.16 10:29

간암세포에서 타겟하는 유전자를 qRT-PCR로 확인하기 위해서 primer로 HCC cell line(Hep3B, Huh7, PLC, SNU423, SNU449, SNU475, SNU368, SNU398)과 NC(MIHA, THLE)로 qRT-PCR 진행했습니다.

그런데 Hep3B, Huh7, PLC, MIHA에서는 증폭이 잘 안되는 2peak이 뜨고 나머지 cell line에서는 1 peak으로 잘 증폭되는 것을 확인했습니다.

또한, 간암조직에서도 qRT-PCR 진행했는데 Tumor에서는 one peeak이 뜨고 non-tumor에서는 증폭이 낮게 2 peak이 나타났습니다.

샘플이 조직일 경우, 조직이라는 특정때문이라고 생각했는데, cell line에서 cell 별고 다른 결과가 나오는 것을 보고 의문이 생겨서요

cell에서 RNA 뽑고 cDNA 합성해서 qRT-PCR 결과, cell 별로 peak이 다르게 나오는 경우가 있나요?

 

#qRT-PCR
 
#HCC cell
 
#Tissue
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
ㅇㅇ  |  01.16 13:25   

프렙 조건과 RNA 퀄리티, PCR 조건이 동일하다는 가정 하에 확인하신 target이 cell 간 variation이 있는 경우면 당연히 그런 결과가 나올 수 있습니다. 1 peak의 경우 잘 발현하는 것으로 볼 수 있고, 2 peak의 경우는 잘 발현하지 않아서 프라이머가 일정 부분 시퀀스가 겹치는 다른 template에 binding하여서 떠졌을 수도 있구요.

아니면 세포마다 splicing variants의 발현 양상이 다른 경우가 있을 수도 있습니다.

일단 해당 내용은 추정일 뿐이므로 모든 샘플에서 1 peak이 떠지는 조건을 잡으시는 것이 제일 바람직합니다. 모든 샘플에서 1 peak이 뜨는 조건에서 비교해 봤을 때 기존 2 peak이 뜨는 샘플들이 밴드가 연하게 보인다면 위 가설이 맞을 겁니다.

결과에서 non-tumor가 2 peak이 뜬 걸로 봐서는 tumor의 severity에 연관되었을 가능성도 있을 것 같습니다.

답변하기
할인행사 광고 검색광고
하나과학 하나과학
Socorex 2020 BIG SALE event - Socorex Acura manual micropipe.. (1.31까지)
케이비티 케이비티
Mixer, Dry Bath, Heating Block, Thermo Shaker, Shaking Incub.. (10.22까지)
다온비에스 다온비에스
내 소중한 세포를 위해 안심하고 맡길 수 있는 WOLF Cell Sorter를 경험하세요! (12.31까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
무료 샘플로 명품 NEB의 DNA/RNA Purifucation 성능을 경험하세요. / NEBulider®.. (9.29까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
[에펜도르프코리아] Eppendorf 2020 하반기 프로모션 행사 : 실험실 필수품 피펫,원심분리기,PCR.. (12.31까지)
인성크로마텍 인성크로마텍
Phenotype MicroArray™ - Live Cell 에너지 대사 & 감수성 프로파일링 (10.31까지)
브래디 브래디
[브래디] 초저온라벨 등 실험실용 라벨링 솔루션 (COVID19 안전사인 등) (10.30까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
TECAN 한국대리점 20주년 기념 Microplate Reader & Washer 할인이 쏟아진다! (12.31까지)
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
3/6  좌우
238,70071,700
136,000
555,000
793,400238,100
50,00015,000
309,000
924,000
47,20044,900
246,60074,000
388,500116,600
139,000132,100
80,40024,200
887,200266,200
143,800136,700
136,000129,200
201,30060,400
158,40047,600
79,50075,600
739,000702,100
379,000
22,7006,900
245,20073,600
230,000
242,40072,800
최근등록   더보기 >
천연페니실린 합성 실험 가설   09.28
매실에서 amygdalin 추출   09.28
플라스미드를 진핵세포에 삽입할 때의 의문점   09.28
human cell total rna gel electrophoresis 결과 band 좀...   09.28
물의 전기분해에 대해 질문합니다.   09.27
전자 전달계로 사용하는 Pdx/Pdr에 관해서 질문이요ㅠㅠㅠㅠ   09.27
백금과 소금으로 물을 소독할 수 있는지요?   09.27
autophagy null cell을 특별히 사용하는 목적이 있나요?   09.27
RNA복제랑 DNA복제 비교   09.27
어떤 실험을 사용해야 할까요   09.27
서울대학교 의과학과
실험관련연재
박은총 연재중후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
Mr.S 연재중의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재중실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
이제욱 연재중생명과학자 기초체력 다지기
이제욱 (오송첨단의료산업진흥재단, 신약개발지원센터)
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아 광고